Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2E2P29084 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GTF2E2P29084 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms