Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ACKR3P25106 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms