Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSR1P21757 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSR1P21757 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MSR1P21757 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MSR1P21757 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MSR1P21757 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MSR1P21757 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms