Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RCC1P18754 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RCC1P18754 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RCC1P18754 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms