Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTPS1P17812 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTPS1P17812 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTPS1P17812 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTPS1P17812 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTPS1P17812 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTPS1P17812 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTPS1P17812 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms