Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXB4P17483 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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