Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GNB3P16520 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GNB3P16520 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GNB3P16520 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms