Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NME1P15531 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NME1P15531 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NME1P15531 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NME1P15531 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms