Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DOBP13765 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HLA-DOBP13765 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms