Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BMP4P12644 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BMP4P12644 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms