Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
KRT3P12035 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KRT3P12035 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KRT3P12035 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KRT3P12035 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT3P12035 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT3P12035 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT3P12035 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT3P12035 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT3P12035 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT3P12035 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT3P12035 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT3P12035 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KRT3P12035 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms