Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMC1P11047 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms