Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHGAP10645 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHGAP10645 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHGAP10645 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHGAP10645 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHGAP10645 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHGAP10645 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms