Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HKR1P10072 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms