Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM225BP0DP42 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms