Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC192P0DO97 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC192P0DO97 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms