Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4BP0C0L5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
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