Protein–RNA interactions for Protein: P07988

SFTPB, Pulmonary surfactant-associated protein B, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPBP07988 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPBP07988 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms