Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB3P05106 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3P05106 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms