Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB1P04280 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB1P04280 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRB1P04280 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRB1P04280 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms