Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POP4O95707 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POP4O95707 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POP4O95707 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POP4O95707 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POP4O95707 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POP4O95707 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POP4O95707 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POP4O95707 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POP4O95707 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms