Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
APOL3O95236 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOL3O95236 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOL3O95236 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOL3O95236 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOL3O95236 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOL3O95236 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOL3O95236 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOL3O95236 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
APOL3O95236 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
APOL3O95236 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms