Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NEBLO76041 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NEBLO76041 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms