Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB3O43889 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB3O43889 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB3O43889 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CREB3O43889 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CREB3O43889 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms