Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNQ2O43526 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ2O43526 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms