Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KCNQ3O43525 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNQ3O43525 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms