Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXC11O43248 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms