Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VGFO15240 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGFO15240 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VGFO15240 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VGFO15240 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VGFO15240 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VGFO15240 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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