Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR1CO15160 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms