Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NPIPA5E9PKD4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms