Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf172C9J069 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms