Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms