Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SOBPA7XYQ1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SOBPA7XYQ1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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