Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARID3CA6NKF2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARID3CA6NKF2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms