Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIPT2A6NK58 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms