Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C5orf49A4QMS7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C5orf49A4QMS7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms