Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
E2F8A0AVK6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms