Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
REXO2Q9Y3B8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
REXO2Q9Y3B8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
REXO2Q9Y3B8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
REXO2Q9Y3B8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms