Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POMPQ9Y244 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POMPQ9Y244 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POMPQ9Y244 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POMPQ9Y244 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms