Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF19Q9UMS4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF19Q9UMS4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRPF19Q9UMS4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms