Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U3

SENP1, Sentrin-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1Q9P0U3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SENP1Q9P0U3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SENP1Q9P0U3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SENP1Q9P0U3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms