Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH4Q9P003 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNIH4Q9P003 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNIH4Q9P003 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNIH4Q9P003 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms