Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR1

NDE1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDE1Q9NXR1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDE1Q9NXR1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDE1Q9NXR1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDE1Q9NXR1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDE1Q9NXR1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms