Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARHGEF3Q9NR81 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARHGEF3Q9NR81 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARHGEF3Q9NR81 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF3Q9NR81 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF3Q9NR81 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF3Q9NR81 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF3Q9NR81 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF3Q9NR81 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF3Q9NR81 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF3Q9NR81 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms