Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ARHGEF4Q9NR80 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARHGEF4Q9NR80 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARHGEF4Q9NR80 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARHGEF4Q9NR80 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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