Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLE4Q9NR33 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLE4Q9NR33 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE4Q9NR33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms