Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NRIP3Q9NQ35 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NRIP3Q9NQ35 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms