Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLCO1B3Q9NPD5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLCO1B3Q9NPD5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLCO1B3Q9NPD5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms