Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RIBC2Q9H4K1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RIBC2Q9H4K1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RIBC2Q9H4K1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms