Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM15Q9C019 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM15Q9C019 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM15Q9C019 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms